Летом 20-го столетия человечество столкнулось с ужасом: планету атаковали огромные чудовища, известные как кайдзю. Возглавлял эту страшную армию Годзилла — непобедимое существо с радиоактивным дыханием. Люди, оставив Землю, отправились в космос в поисках нового дома. Но через два десятилетия поняли: найти новую жизнеспособную планету сложнее, чем казалось. Харуто, плывший в космосе еще ребенком, вернулся с мыслью о необходимости борьбы за родную планету. Возродив идею сопротивления, люди возвращаются на Землю через 20 000 лет после своего отступления. Но мир изменился: Годзилла и другие кайдзю правят планетой, а наш вид оказывается на грани вымирания.