Когда-то считалось, что Звездные врата, позволяющие совершать быстрые межгалактические перелеты, существуют в единственном экземпляре. Однако стоило команде полковника О\'Нилла немного отдохнуть от последней миссии, как их вновь вызвали на задание. Военные ВВС США сообщили, что во Вселенной существует множество таких порталов. Один из них использовал злодей Апофис, представитель расы, к которой принадлежал и Ра. Жаждя мести за гибель своего соратника, Апофис нападает на Абидос, похищая Шаури и Скаару, а остальных местных жителей безжалостно убивая. Перед О\'Ниллом и его командой стоит новая задача: найти и нейтрализовать Апофиса, а также опечатать все Звездные врата, до которых они смогут добраться. Однако Вселенная необъятна, и их миссия может затянуться на многие годы, полные опасностей. Воинам Земли предстоит попрощаться с родными и друзьями, чтобы вновь отправиться покорять бескрайний космос, обезвреживать врагов и защищать свою планету от новых угроз.