В альтернативной реальности, напоминающей начало XX века, юная Сита владеет Летающим Камнем, за которым охотятся правительственные агенты и пираты, ведь его ценность невероятно велика. Убегая от преследователей, Сита встречает Падзу, мальчика из шахтёрского городка. Вместе они узнают, что Камень — ключ к загадочному парящему острову Лапута.